北斗导航卫星以“一箭双星”方式发射两颗大型卫星与以往的“一箭单星”发射不同，在技术和管理上带来一些新的课题。

在卫星研制方面，“一箭双星”发射对于“北斗”卫星出厂前的工作提出了非常明确的进度和质量要求。一支研制队伍同时兼顾两颗卫星，这两颗卫星必须同时具备出厂要求和状态，因此卫星研制团队优化了流程，举一反三，不能留有任何质量问题隐患，把所有工作都要做到位。

在发射场方面，这是我国第一次同时发射两颗相同的大卫星，对西昌卫星发射中心来说，以往没有接受过这样的任务，因此在执行任务期间，卫星系统与发射场系统的协调方面需要做很多工作，制定了发射场流程和风险预案。首先，卫星被送往发射场后的工作安排，要有一个明确的策划，包括场地安排和工作项目；卫星在发射场的环境和条件与出厂前的都不一样，必须按照新的环境、新的条件做好预案。其次，在发射场对卫星进行测试的整个过程中，需要注意两颗卫星相互之间的影响，特别是电磁干扰方面。第三，在卫星和运载火箭从技术区转移到发射区的状态与以往也不一样，以往在“一箭单星”发射时，卫星在技术区完成测试，被装在包装箱里运到发射塔架，与运载火箭对接之后，再盖上火箭的整流罩；而用“一箭双星”发射“北斗”卫星，由于各方面条件的约束，必须在厂房里把两颗卫星一上一下放好，把整流罩扣好，整体转移到发射塔架。在这个过程中，需要卫星系统、火箭系统和发射场系统三方面进行协调。第四，北斗两次“一箭双星”发射的是中圆轨道卫星，按照星座的设计，发射窗口只有10分钟左右的时间，如果其中一颗卫星发射前状态的设置出现问题，就有可能导致发射时间推迟，会造成非常大的影响。

另外，在星箭分离这件事情上也要解决过去从未遇到的问题。以往“一箭多星”同时发射一颗大卫星和几颗小卫星时，星箭分离之后，这些卫星会各飞各的轨道；而用“一箭双星”发射“北斗”中圆轨道卫星时，星箭分离后两颗卫星必须精确进入同一个轨道面的不同轨位上，同时又要避免两颗卫星距离太近而发生碰撞。